Situa-se entre o Distrito Federal (maior parte) e o Estado de Goiás, em torno da bacia do Rio Descoberto, com quase 40 mil hectares. Esta APA foi criada pelo decreto federal 88.940 de 7 de novembro de 1983, protegendo a região em torno da represa do rio Descoberto (que abastece 60% de Brasília) e da cidade-satélite de Brazlandia (DF).
Contratado em 1994, o rezoneamento ainda não foi concluído. Esta APA sofre forte pressão da ocupação desordenada do solo, principalmente com a criação de Águas Lindas (GO), uma cidade que em poucos anos viu sua população multiplicar-se várias vezes com a chegada de imigrantes, sem infra-estrutura.
Do lado do DF enfrenta problemas com o parcelamento de terras, inclusive da zona de chácaras.