Entrando por braços mais largos, chega-se às lagoas internas que se formam de ambos os lados do rio Araguaia, depois que baixam as águas das enchentes anuais. São nichos de vida, criatórios de peixes raros como o pirarucu, e bebedouro seguro para veados-campeiros - quando não vão atrás as onças. Alguns exemplos de lagos são o Montaria, o Teeira e o Vacas.